على الرغم من مستوى الحماية العالي الذي توفره معظم خدمات التخزين السحابي، إلا أن تعرض حساب المستخدم للاختراق وارد لأي سبب من الأسباب، وتخرين الملفات سحابياً من دون حماية يدوية يعني سهولة انتشارها في حالة الاختراق.

لذا يمكن لمستخدمي خدمات التخزين السحابي دروب بوكس، غوغل درايف وسكاي درايف الاستعانة ببرنامج cloudfogger.com المجاني والذي يقوم بتشفير الملفات قبل تخزينها سحابياً لزيادة مستوى الحماية.

مستخدمو أندرويد وآيفون يمكنهم أيضاً تثبيت التطبيق لتشفير الصور التي تخزّن من الأجهزة الذكية، وكذلك الأمر بالنسبة لمستخدمي الحاسب، فكل ما يحتاجه المستخدم هو تثبيت البرنامج وتسجيل الدخول باستخدام حسابه.