احتلت جامعة تونس المنار المرتبة الأولى على المستوييت المغاربي والمحلي في تصنيف شنغهاي الأكاديمي للجامعات في العام 2021، الذي يضم 500 جامعة حول الحالم.
وبحسب هذه التصنيفات، تمكنت جامعة تونس المنار من تحقيق المرتبة 401 على 500 في مادة الرياضيات و301 - 500 في مادة الهندسة الميكانيكية و201-300 جامعة في مادة العلوم البيطرية و401-500 في مادة الطب السريري و301-400 في مادة الصحة العامة.
ويعتمد تصنيف شنغهاي "على عدد المقالات والمواضيع التي تنشر في المجلتين الشهيرتين 'ساينس' و'نيتشر' وعلى عدد وجودة المقالات الواردة في دليل النشر العلمي، ودليل النشر للعلوم الاجتماعيّة، ودليل النشر للفنون والعلوم الإنسانيّة إضافة إلى عدد جوائز نوبل وأوسمة فيلدز التي أسندت إلى طلبتها ومدرسيها وإلى حجم المؤسسة العلميّة ونشاطها الأكاديمي".